Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
FmodP50608 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
FmodP50608 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
FmodP50608 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms