Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SftpbP50405 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SftpbP50405 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SftpbP50405 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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