Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmod1P49813 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Tmod1P49813 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms