Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sept1P42209 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms