Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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VhlP40338 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VhlP40338 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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VhlP40338 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VhlP40338 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
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