Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lig1P37913 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lig1P37913 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lig1P37913 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lig1P37913 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lig1P37913 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lig1P37913 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lig1P37913 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lig1P37913 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lig1P37913 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lig1P37913 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Lig1P37913 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Lig1P37913 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms