Protein–RNA interactions for Protein: P35428

Hes1, Transcription factor HES-1, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes1P35428 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hes1P35428 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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