Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Hoxc5P32043 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms