Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CftrP26361 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CftrP26361 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CftrP26361 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CftrP26361 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CftrP26361 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms