Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pou2f1P25425 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms