Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrkchP23298 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms