Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PparaP23204 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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PparaP23204 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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PparaP23204 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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PparaP23204 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PparaP23204 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PparaP23204 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PparaP23204 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PparaP23204 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PparaP23204 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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