Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pou3f1P21952 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pou3f1P21952 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms