Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prim1P20664 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Prim1P20664 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms