Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
P20040 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P20040 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P20040 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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