Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P18528 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P18528 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
P18528 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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