Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Hoxb1P17919 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms