Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ApcsP12246 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ApcsP12246 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms