Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
UbbP0CG49 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms