Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
PtprqP0C5E4 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms