Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Itgb1P09055 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Itgb1P09055 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms