Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Spta1P08032 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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