Protein–RNA interactions for Protein: P07607

Tyms, Thymidylate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TymsP07607 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
TymsP07607 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
TymsP07607 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
TymsP07607 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
TymsP07607 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms