Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ifna6P07350 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna6P07350 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna6P07350 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna6P07350 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna6P07350 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna6P07350 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna6P07350 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna6P07350 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ifna6P07350 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms