Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
CrygdP04342 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
CrygdP04342 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms