Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cops6O88545 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cops6O88545 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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