Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lnx1O70263 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lnx1O70263 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lnx1O70263 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lnx1O70263 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lnx1O70263 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lnx1O70263 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lnx1O70263 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lnx1O70263 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Lnx1O70263 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lnx1O70263 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lnx1O70263 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lnx1O70263 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lnx1O70263 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lnx1O70263 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lnx1O70263 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Lnx1O70263 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lnx1O70263 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lnx1O70263 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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