Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ldb2O55203 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ldb2O55203 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ldb2O55203 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ldb2O55203 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ldb2O55203 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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