Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
E2f6O54917 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
E2f6O54917 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms