Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TsksO54887 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TsksO54887 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TsksO54887 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TsksO54887 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms