Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
DffaO54786 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
DffaO54786 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
DffaO54786 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
DffaO54786 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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