Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
CrxO54751 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
CrxO54751 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
CrxO54751 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms