Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Sdc4O35988 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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