Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Cnih1O35372 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Cnih1O35372 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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