Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Pitx3O35160 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms