Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casq1O09165 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Casq1O09165 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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