Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms