Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC024978J3QPC3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms