Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm20918J3QN17 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Gm20918J3QN17 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm20918J3QN17 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
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