Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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