Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm3415J3QMS8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm3415J3QMS8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms