Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
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Gm21818J3KMS6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm21818J3KMS6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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