Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Vmn1r58G3X9U3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms