Protein–RNA interactions for Protein: G3UW87

Gm17455, MCG55969, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17455G3UW87 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Gm17455G3UW87 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Gm17455G3UW87 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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