Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
LctF8VPT3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms