Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Baz2a-208ENSMUST00000220049 8443 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm2897-201ENSMUST00000166494 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Fras1-201ENSMUST00000036019 15848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 B3galt5-202ENSMUST00000113800 5282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 E330012B07Rik-202ENSMUST00000151979 2349 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Gm20538F6Z9R1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pdlim5-203ENSMUST00000090134 1722 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Epn2-213ENSMUST00000179936 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Psma2-201ENSMUST00000170836 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cass4-201ENSMUST00000099061 3731 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dapp1-201ENSMUST00000029806 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm37266-201ENSMUST00000193802 2287 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mecp2-205ENSMUST00000170481 10175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Lrrc49-210ENSMUST00000166168 2784 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Ppargc1a-205ENSMUST00000196968 2754 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm28557-203ENSMUST00000186303 3886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Gm20538F6Z9R1 Paqr8-204ENSMUST00000189400 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms