Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Gm8005F6YKY3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8005F6YKY3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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