Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm5218F6YH22 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms