Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sptbn5F6UCX4 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sptbn5F6UCX4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms