Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm10477F6SW83 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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